p.164 の当該箇所の説明を以下のように修正しようと思いますが、いかがでしょうか？ ＞ titou36jpさん、0829さん、あるいはすべての読者の皆さん

ここでの説明は、『「コンテンツの作成」ページにリンクを追加するために hook_menu() は不要』ということと、『必要に応じてそれらも変更可能』ということを説明しているのだと思いますし、パーミッション云々はこの後で説明と実装がされていますので、この段階で説明するのは適当ではないように思います。
ですので、単に『ダイレクトリンクを追加したくない場合は削除可能』という点に絞った説明とコードに変更してみました。
ちなみに変更後のコードは、リンクは非表示となりますが、ダイレクトにアクセスすることは可能というものです。

セクションのタイトル

■ menuコールバックの変更
↓↓↓
■ メニュー項目の変更

文章

ダイレクトリンクを追加したくない場合は、hook_menu_alter()を使用して削除することが
できます。例えば次のコードは、「ノードの管理」 権限を持たないユーザからページを削除す
るコードです。
↓↓↓
ダイレクトリンクを追加したくない場合は、hook_menu_link_alter()を使用して削除することが
できます。例えば次のコードは、「jokeの作成」ページへのダイレクトリンクを非表示にする
コードです。

コード

/**
 * hook_menu_alter()の実装
 */
function joke_menu_alter(&$callbacks) {
  // ユーザが「ノードの管理」権限を持たない場合、
  // access callbackをFALSEに設定してjokeメニュー項目を無効にする
  if (!user_access('administer nodes')) {
    $callbacks['node/add/joke']['access callback'] = FALSE;
    // デフォルトのアクセスコールバックとしてuser_access()を使用されないために、
    // access argumentsを破棄する必要がある
    unset($callbacks['node/add/joke']['access arguments']);
  }
}

↓↓↓

/**
 * hook_menu_link_alter()の実装
 */
function joke_menu_link_alter(&$item, $menu) {
  // 「jokeの作成」ページへのダイレクトリンクを非表示にする
  if ($item['link_path'] == 'node/add/joke') {
    $item['hidden'] = 1;
  }
}

P174の「menuコールバックの変更」について

正しくは p.164 ですのでタイトルを修正しました。

自分の理解ですと「administer nodes」権限を持つユーザーは「管理者」であると認識しています。
また、「hook_menu_alter()」がDrupalからコールされるタイミングは
モジュールを有効にした場合のみ
つまり、「管理者」以外はモジュールを有効に出来ないと理解しています。

根本的な認識に誤りがあるようです。
Drupalでは、自動的にすべての権限を持つスーパーユーザ（ユーザIDが1）以外は、ロールごとにあらゆる権限の許可・不許可を設定することができ、「administer nodes」権限も例外ではありません。
おそらく、他のCMSなどに見られる単純な権限区分（管理者・登録ユーザ・ゲストなど）が念頭にあるのだと思いますが、Drupalではその「管理者」の定義は当てはまりません。
また、hook_menu_alter()がコールされるタイミングは、モジュールが有効で、かつ、メニューが構築される際です。

従いまして
if (!user_access('administer nodes')) {
$callbacks['node/add/joke']['access callback'] = FALSE;
unset($callbacks['node/add/joke']['access arguments']);
}
の条件が通り、上記のif文内のブロックが実行される場合は有るのでしょうか？

このコードは正しく動作します。

完全にすべての権限を持っているユーザを「管理者」とするのであれば、Drupal では、インストール時に作成する特別なユーザ（「ユーザ ID が "1" のユーザ」や「スーパーユーザ」などと呼ばれます）がそれに当たると思います。

ただ、Drupal では、ユーザ ID が "1" のユーザを除くすべてのユーザは、必ずいずれかのロールに属すことになり、それぞれのロール単位で詳細な権限の設定を行うことができるようになっていますので、どんなユーザでも、設定によっては "ノードの管理（administer nodes）権限は持たず、モジュールのインストール権限を持つユーザ" になり得ます。

ですので、「if (!user_access('administer nodes')) 」の条件を満たすことは可能かと...

なお、P.174 にて該当部分を見つけられませんでしたので、見当違いの回答になっていた場合にはご容赦ください。

[修正：該当箇所は P.164 ページだったようですので、タイトルのみ変更させて頂きました。]